RTK定位的誤差，一般分為兩類
- 同儀器和干擾有關的誤差：包括天線相位中心變化、多徑誤差、信號干擾和氣象因素。
- 同距離有關的誤差：包括軌道誤差、電離層誤差和對流層誤差。
對固定基準站而言，同儀器和干擾有關的誤差可通過各種校正方法予以削弱，同距離有關的誤差將隨移動站至基準站的距離的增加而加大，所以RTK的有效作業半徑是非常有限的（一般小于20幾公里）。
同儀器和干擾有關的誤差
1、天線相位中心變化
天線的機械中心和電子相位中心一般不重合。而且電子相位中心是變化的，它取決于接收信號的頻率、方位角和高度角。天線相位中心的變化，可使點位坐標的誤差一般達到3-5cm。
因此，若要提高RTK定位精度，必須進行天線檢驗校正，檢驗方法分為實驗室內的絕對檢驗法和野外檢驗法。
2、多徑誤差
多徑誤差是RTK定位測量中最嚴重的誤差。多徑誤差取決于天線周圍的環境。多徑誤差一般為幾厘米，高反射環境下可超過10cm。
多徑誤差可通過下列措施予以削弱：A、選擇合適的站址①測站應遠離大面積平靜的水面。灌木叢、草和其他地面植被能較好地吸收微波信號的能量，是較為理想的設站地址。翻耕后的土地和其他粗糙不平的地面的反射能力也較差，也可以選站。②測站不宜選擇在山坡、山谷和盆地中。以避免反射信號從天線抑徑板上方進入天線，產生多路徑效應。③測站應離開高層建筑物。觀測時，汽車也不要停放得離測站附近。B、 ①在天線中設置抑徑板。②接收天線對于極化特性不同的反射信號應該有較強的抑制作用。
3、信號干擾
信號干擾可能有多種原因，如無線電發射源、雷達裝置、高壓線等，干擾的強度取決于頻率、發射臺功率和至干擾源的距離。
為了削弱電磁波幅射副作用，必須在選點時遠離這些干擾源，離無線電發射臺應超過200米，離高壓線應超過50米。在基地站削弱天線電噪聲最有效的方法是連續監測所有可見衛星的周跳和信噪比。
4、氣象因素
快速運動中的氣象峰面，可能導致觀測坐標的變化達到1-2dm。
因此，在天氣急劇變化時不宜進行RTK測量。
同距離有關的誤差
同距離有關的誤差的主要部分可通過多基準站技術來消除。但是，其殘余部分也隨著至基地站距離的增加而加大。
1、軌道誤差
目前，軌道誤差只有幾米，其殘余的相對誤差影響約為1ppm，就短基線（<10km）而言，對結果的影響可忽略不計。但是，對20-30km的基線則可達到幾厘米。
2、電離層誤差
電離層引起電磁波傳播延遲從而產生誤差，其延遲強度與電離層的電子密度密切相關，電離層的電子密度隨太陽黑子活動狀況、地理位置、季節變化、晝夜不同而變化，白天為夜間的5倍，冬季為夏季的5倍，太陽黑子活動最強時為最弱時的4倍。利用下列方法使電離層誤差得到有效的消除和削弱：利用雙頻接收機將L1和L2的觀測值進行線性組合來消除電離層的影響；利用兩個以上觀測站同步觀測量求差（短基線）；利用電離層模型加以改正。
實際上RTK技術一般都考慮了上述因素和辦法。但在太陽黑子爆發期內，不但RTK測量無法進行，即使靜態GPS測量也會受到嚴重影響，太陽黑子平靜期，小于5ppm。
3、對流層誤差
對流層是高度為40km以下的大氣層，其大氣密度比電離層更大，大氣狀態也更復制。對流層與地面接觸并從地面得到輻射熱能，其溫度隨高度的上升而降低，GPS信號通過對流層時也使傳播的路徑發生彎曲，從而使距離測量產生偏差，這種現象叫做對流層折射。
對流層的折射與地面氣候、大氣壓力、溫度和濕度變化密切相關，這也使得對流層折射比電離層折射更復雜。對流層折射的影響與信號的高度角有關，當在天頂方向（高度角為90°），其影響達2.3m；當在地面方向（高度角為10°），其影響可達20m。
RTK模式時移動站和基準站有效作用半徑相距不太遠（一般小于20km），由于信號通過對流層的路徑相似，所以對同一衛星的同步觀測值求差，可以明顯地減弱對流層折射的影響。這一方法在精密測量相對定位中被廣泛應用。